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    Nature:科學(xué)家研發(fā)出估計艾滋疫情動(dòng)態(tài)的新方法

    2013-11-29 09:59 閱讀:2923 來(lái)源:環(huán)球醫學(xué)資訊 責任編輯:李思杰
    [導讀] 11月19日的Nature雜志上公布了一項關(guān)于艾滋病的最新研究結果,來(lái)自L(fǎng)osAlamos國家實(shí)驗室的研究人員追蹤分析了流行病學(xué)意義上艾滋病患者HIV病毒擴散,以及系統發(fā)育學(xué)意義上病毒實(shí)際的快速進(jìn)化之間的復雜關(guān)聯(lián),由此研發(fā)出了一種新穎的方式,用于解析HIV病毒的擴

        11月19日的Nature雜志上公布了一項關(guān)于艾滋病的最新研究結果,來(lái)自L(fǎng)osAlamos國家實(shí)驗室的研究人員追蹤分析了流行病學(xué)意義上艾滋病患者HIV病毒擴散,以及系統發(fā)育學(xué)意義上病毒實(shí)際的快速進(jìn)化之間的復雜關(guān)聯(lián),由此研發(fā)出了一種新穎的方式,用于解析HIV病毒的擴散與演化。這種方法能用于區分HIV易感人群與受感染人群,從而解析整個(gè)感染史,比如感染個(gè)體的關(guān)聯(lián)追蹤數據。
     


        文章的第一作者ThomasLeitner表示,“我們研發(fā)出了一種能用于估計疫情動(dòng)態(tài)的新方法,從中我們可以了解是誰(shuí)感染了誰(shuí),以及真正的人口感染發(fā)生率與單純的診斷日期。很顯然這些十分重要,尤其是對于公共衛生監控,決策和干預疫情,以及進(jìn)一步的取證調查。”

        研究人員采用傳統的計算機差分方程(differentialequations)對未感染人群進(jìn)行了模型分析,因為基于agent中介的組件分析較為苛刻,因此這種方法有助于提高速度。一旦某個(gè)人被感染,那么他/她就可以作為一個(gè)“中介”用于計算機建模,模型就開(kāi)始追蹤他們的行為,以及艾滋病病毒的進(jìn)化。

        基于中介的建模

        這種新的建模方法能區分易感個(gè)體與感染個(gè)體,從而捕獲整個(gè)感染史。未感染個(gè)體基于一個(gè)人口水平進(jìn)行建模,并通過(guò)傳播風(fēng)險和社會(huì )團體分層。在這個(gè)模型中形成社會(huì )網(wǎng)絡(luò )——模擬過(guò)程中可變。因此,該模型比傳統模型更加接近現實(shí)。

        Leitner說(shuō),流行病學(xué)模型的優(yōu)勢在于“它使我們能夠利用人類(lèi)交往的參數模擬流行疾病的

        多種可能結果,其中社交網(wǎng)絡(luò )的形成是中介社交的一部分。這是一個(gè)靈活的系統,能用來(lái)描述現實(shí)人群中的變化。”

        這個(gè)項目得到了美國NIH的資助,其相關(guān)項目“ReconstructingHIVEpidemicsfromHIVPhylogenetics”已發(fā)表論文10篇。

        誰(shuí)感染了誰(shuí)

        其中一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題就是誰(shuí)感染了誰(shuí),此前發(fā)表在另外一個(gè)刊物的研究成果,提出了一種新雜交系統,能用于模擬和分析艾滋病毒或其它病原體在人群中的傳播。

        研究人員對LatvianHIV-1病毒進(jìn)行了建模,他們發(fā)現注射***者促進(jìn)了異性人口中病毒的傳播,從而導致了整體疫情。研究人員目前正在擴大這種雜交模型,將其延伸到HIV遺傳進(jìn)化領(lǐng)域中,分析它對每一個(gè)受感染個(gè)體的影響。

        研究表明,在HIV快速流行過(guò)程中,比如個(gè)體之間自行注射藥物,HIV病毒的進(jìn)化是緩慢的,出現的人群水平多元化很小。而且較慢的病毒擴散也顯示出在同等時(shí)間內更多艾滋病毒的演化。

        新研究領(lǐng)域

        了解HIV病毒的遺傳進(jìn)化有助于研究人員通過(guò)病原體遺傳物質(zhì)重構不同的流行病學(xué)場(chǎng)景,這一研究領(lǐng)域被稱(chēng)為系統發(fā)育動(dòng)態(tài)研究(phylodynamics,生物通譯)。

        這項研究還開(kāi)發(fā)了一種新的數學(xué)模型利用這種模型,研究人員能方便地通過(guò)之前用過(guò)的生物標記物(BEDIgG)估計何時(shí)個(gè)體會(huì )感染了HIV病毒。

        “這很重要,因為大多數HIV病毒感染者在感染后不久都沒(méi)有察覺(jué)到已經(jīng)受到感染,他們往往在很久之后才發(fā)現,比如感染后幾年,”Leitner說(shuō),“因此需要估計真正的發(fā)病率,也就是實(shí)際發(fā)生感染的時(shí)間,而不是診斷日期。”
     
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    文章正在更新中……


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